前言
1961年10月21日，在华社和反对党激烈反对下，国会通过《1961年教育法令》，把《1960年教育检讨报告书》的建议赋予法律地位。此法令强调要发展一个以国语为主要教学媒介的教育制度，肯定国家教育政策的“最终目标”。这对于南华独中是沉重的打击！南华独立中学坚持华教！宁可放弃津贴金，成为独立中学！
在这个政府不支持的背景下于20世纪70年代，南华独中一度濒临关闭。此时以颜清文律师为首的华教工作者站了出来！展开了轰轰烈烈的拯救运动，这不仅仅是拯救南华独立中学，更是拯救了华文教育！
1962年
1962年，22万元之大礼堂及科学馆建设方告落成，由当时位副教育局长亚都哈蜜干主持开幕。 由于教育政策转变，南华中学逐分为南华国中与南华独中。前者由金能 襄先生担任校长，后者则由南大学士江禄森先生处理校务。独中学生人数逐渐减 少， 江禄森先生辞职，后由台湾师范大学毕业的张奕东掌校。
1963～1969年
1964年由陈扬炎先生接任校长职务。
1969年，陈际强先生担任代校长至4月，5月开始则由林秀文先生出任校长。
1971年
学校经济拮据，在存亡边缘挣扎。4月4日由校方发函召开董教、 社团以及校友等特别会议， 毅然议决继续把南华独中办下去，并即刻开展救校运动。南华独中原任董事长颜清文律师再度被推选为董事长，南大理学士许瑞成先生出任复兴后首任校长。
1972～1974年
1972年学生人数增至此120位，为了南华独中的发展，在董教生三方面通力合作之下，兴建独中第一 期四间教室。 1973年兴建第二期校舍八间教室。1974年兴建第三期校舍，内设有打字室、贩卖部、摄影室及冷气图书馆，学生人数增至三百多位。
1975～1978年
1976年政府实施贷书及免学费制度，独中生源深受打击，南华独中学生人数骤然下降。 1977年许瑞成校长辞职。 1978年台湾师范大学理学士蔡传山先生担任第二任校长，学生人数132位。至年杪，蔡校长辞职，后由台大文学硕士林亚泰先生担任第三任校长，全校学生人数只有125名。 年杪，董事部、社会人士及教职员同心协力，改变招生策略，先后在爱大华、邦咯岛及实兆远等 区召开座谈会，获得各界热烈反应。